- 產品介紹
XM-Q800R3聚能式超聲DNA剪切儀是小美超聲公司是國內較早為CHIP實驗(染色質免疫共沉淀—一種研究蛋白與DNA相互作用的技術)而設計的,整套設備由一體式主機、聚能式換能器、杯式探頭、樣品支架、可透視消音箱和冷卻水循環機等幾個部分組成。經二代測序儀Illumina廠家實驗室測試使用,設備的性能和實驗結果非常好,媲美進口產品。
全基因組測序(Whole Genome Sequencing, WGS)是基因組較為多的研究方案。WGS通過對人類細胞中的基因組(包括線粒體)所有的30億堿基進行測序,測定其DNA的堿基序列,從而可在全基因組水平上檢測與人類疾病相關的單核苷酸變異(SNVs)、插入缺失(In Dels)、拷貝數變異(CNVs)和結構變異(SVs)等多種突變信息,進而得到完整的人體“說明書”。XM-Q800R3打斷儀為全基因提供高效、均一、穩定的樣品前處理。

- 應用公司介紹
希望組(Grandomics)是三代測序大數據技術和應用的開拓者,成立于2011年8月8日,曾用“未來組”品牌開拓三代測序科技服務,是三代測序服務公司和三代測序大數據診斷公司。
多年來,一直專注于在三代測序平臺上進行技術開發與應用拓展,目前,已經形成了“科技服務”、“醫學診斷”、“生物信息”、“先進制造”四大業務模塊;在北京、武漢建設了合計超過5,000平米的科研服務平臺、醫學檢驗實驗室;引進了國際先進的ONT PromethION 48、PacBio Sequel II、MGISEQ2000/T7、Bionano Saphyr光學圖譜等技術平臺。

非接觸式DNA打斷是全基因組測序的前處理步驟,打斷效果是否均一、穩定,這關系著是否影響后續全基因組序列的準確性。測試階段客戶使用參數為:4℃循環水。百分100功率,運行10s,停止10s,15分鐘打斷效果如下圖:agilent 2100測試結果表明時間過長,均一性不好。

經過調整后,效果提升。


根據片段大小,可以調整不同的實驗時間和功率。
- 應用展望
全基因組測序基本上在所有三代測序這個都有大范圍的應用,我司非接觸式DNA打斷儀有多種通量和效率可以選擇,XM-Q800R3是目前效率較高,但是通量較小的一款設備,通過與未來組的合作應用,我們將加速研發改進設備的應用,使其更加匹配到全基因組測序的服務中。